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非小細胞肺癌非常見基因突變的概念及臨床意義

2022-04-01 11:30 閱讀:13477 來源:愛愛醫(yī) 作者:張建鑫 責任編輯:柳葉彎刀
[導讀] 隨著對肺癌研究的深入,越來越多的驅(qū)動基因突變被研究者發(fā)現(xiàn)。除最具代表性的表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因發(fā)生突變及間變性淋巴瘤激酶(amupilastic lymphoma kiname,ALK)基因突變之外,還有諸多非常見的非小細胞肺癌驅(qū)動基因,通常認為,非小細胞肺癌的非常見突變,即罕見實變,常指代須率<5%的致癌驅(qū)動基因突變。比如 ROSI、BRAF、NTRK、HER2、MET、RET、EGER20外顯子插入、NRGI、EGERI等。

隨著對肺癌研究的深入,越來越多的驅(qū)動基因突變被研究者發(fā)現(xiàn)。除最具代表性的表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)基因發(fā)生突變及間變性淋巴瘤激酶amupilastic lymphoma kiname,ALK)基因突變之外,還有諸多非常見的非小細胞肺癌驅(qū)動基因,通常認為,非小細胞肺癌的非常見突變,即罕見實變,常指代須率<5%的致癌驅(qū)動基因突變。比如 ROSIBRAF、NTRK、HER2MET、RET、EGER20外顯子插入、NRGIEGERI等。以下分別簡要介紹這些基因改變的情況。

1.EGFR基因非常見突變

表皮生長因子受體(EGFR)是一種跨膜糖蛋白,位于7號染色體的7p21.14區(qū)。EGFR是酪氨酸激酶型受體,是ErbB家族成員,也可稱為ErbB1HERIEGFR20外顯子插入突變屬于罕見的EGFR突變模式。通過全面的基因組圖譜分析comprehensive genomic profiling,CGP),一項包含14483例非小細胞癌病例的研究中,檢測出1.8%EGFR 20外顯子插入突變,占總EGFR突變病例的12%,鑒定出的64EGFR 20外顯子插人模式中,最常見的是D770_N771>ASVDN(21%)N771_P772>SVDNP(20%)。一項納入2004-2012年的186例患者的研究顯示,與基因突變陰性的非小細胞肺癌相比,EGFR20外顯子插入在從未吸煙者和亞洲患者中更為常見,同時,EGFR20外顯子插入突變患者的中位生存期與野生型癌癥的生存期相似,比具有常見EGFR突變的患者的生存期短。此外G719X

S7681L861Q非常見突變的發(fā)生率在3%左右,男性和吸煙者在這些EGFR非常見突變患者當中似乎占比更高

2.ROSI 基因易位

人類原癌基因ROSI位于染色體6q22.1帶,也稱MCF3c-ros-1,編碼一種受體酪氨酸激酶,在1%~2%的非小細胞癌中發(fā)揮驅(qū)動癌基因的作用,發(fā)揮作用的方式是ROS1與其他基因發(fā)生基因易位,包括CD74,SLC34A2、SDC4EZR、FIG、TPM3LRIG3、KDELR2,CCDC6MSN、TMEM106B、TPD52L、CLTC、LMAl,其中最常見的是CD74。ROSl易位的識別方法為熒光原位雜交(nuorescent in situ hybridization,FISH)分離分析,或者通過些二代測序(nexi generation sequencing,NGS)平臺識別。ALkROSI酪氨酸激酶的結構域部分同源,因而ROSI酪氨酸激酶對克唑替尼治療敏感。一項針對非小細胞肺癌的基因檢測篩選了1073名非小細胞癌患者,研究發(fā)現(xiàn),在ROSI易位的患者中,肺

瘤組織學常為腺癌,且具有更高的分級趨勢。對比ROSI陰性病例,ROS1陽性組以較年輕、從不吸煙的人群為主。

3.BRAF基因突變

B-Raf原癌蛋白(B-Raf proto-oncoprotein,BRAF)KRAS的下游信號調(diào)節(jié)因子,是一種絲氨酸(蘇氨酸)激酶,活化絲裂原活化蛋白激酶(mitogen activated protein kinase,MAPK)通路。BRAF突變見于1.5%~3.5%的非小細胞肺癌這些突變最常發(fā)生于15外顯子的V600E位點。BRAF突變最常見于黑色素瘤,在黑色素瘤中存在50%左右的突變幾率,15外顯子的V600E位點是最常見的突變點。BRAF突變通常采用PCR測序或NGS法檢測。一項單中心病例研究顯示,在2009-2013年診斷的63例肺腺癌患者中,BRAF V600E突變的病人更可能是輕度或從不吸煙者,而且進展期BRAF突變患者的預后顯著優(yōu)于非V600E突變患者(3年生存率24%vs0%)

4.NTRK基因突變

原肌球蛋白受體激酶(tropomyosin receptor kinase,TRK)家族包括TRKA、TRKBTRKC三種蛋白,它們分別由神經(jīng)營養(yǎng)因子受體絡氨酸激酶(neurotrophic tropomyosin receplarkinase,NTRK)中的NTRKI、NTRK2NTRK3基因編碼,常在神經(jīng)組織中表達。在非小細胞肺癌中,NTRK發(fā)生的突變主要為NTRKINTRK2重排。既往針對91例患者的研究中,有3.3%的標本存在NTRKI融合,CD74、MPRIP、SOSTMI、TRIM24都是其可融合的對象。但是NTRK相關的臨床及病理特征尚不明朗。

5.HER2基因突變

人類表皮生長因子受體2(HER2ErbB2)ErbB家族中的膜結合酪氨酸激酶。與EGFR(ErbB1)不同,HER2缺乏內(nèi)源性配體。HER2基因突變被認為是致癌的潛在驅(qū)動因素,可表達于乳腺癌、卵巢癌、骨肉瘤和肺癌中。肺腺癌中檢出HER2突變概率為1%~2%。既往研究測試了3800名肺癌患者,其中1.7%鑒定出HER2突變。另一研究對1478份肺腺癌樣本進行EGFR(1921外顯子)和KRAS(2外顯子)突變檢測后,對陰性病例進行HER2突變(第19~20外顯子)檢測。共檢測出25HER2突變病例,占EGFR/KRAS/ALK陰性標本的6%,占總樣本量的1.6%。其中,以20外顯子的插入突變?yōu)橹鳎急?/span>96%.從病理分化程度上區(qū)分,有92%為中等或低分化腺癌。同時,HER2突變顯著存在于從不吸煙者中。2010年一篇綜合40例研究,共總結6135名病人的薈萃分析顯示,HER2突變在非小細胞肺癌中預后顯著較差與突變不同的是,在非小細胞肺癌中,HER2擴增不是致癌的驅(qū)動突變,而是EGFR-TKIs耐藥的次要機制之一。

6.MET基因異常

間充質(zhì)上皮轉(zhuǎn)移因子(the mesenchymal-to-epithelial transition,MET)基因位于7號染色體,是一種受體激酶,通過結合配體肝細胞生長因子(HGF)并誘導MET二聚化和自磷酸化,來激活酪氨酸激酶。在非小細胞肺癌中,多種MET激活機制已被確定,包括MET基因的突變、重排或擴增。外顯子14跳躍突變最常通過NGS發(fā)現(xiàn),而MET擴增可通過FISH或一些NGS平臺檢出。通過38028例患者的腫瘤基因組圖譜分析,MET 14外顯子跳躍突變在肺腺癌中檢出率為3%,而包含36例肺肉瘤樣癌患者的小樣本研究中,MET14外顯子跳躍突變識別檢出率甚至可達到22%。MET基因擴增存在于1.4%~5.6%的未經(jīng)治療的非小細胞肺癌中。而對獲得EGFR抑制劑耐藥的EGFR突變腫瘤的患者進行檢測,MET在病例中存在擴增的概率甚至高達11%~22%。在以往的研究中,IVMET14外顯子突變的非小細胞肺癌比IA期到IBMET外顯子更有可能同時發(fā)生MET基因組擴增。同時,MET基因擴增的患者預后明顯較差。

7.RET基因易位

原癌基因 RET(rearranged during transfection)位于染色體10q11.2帶,編碼一種細胞表面受體酪氨酸激酶,甲狀腺髓樣癌中常發(fā)生該基因改變。在非小細胞肺癌中,RET至少有12個不同的基因重排對象,包括KIF5BCCDC6、NCOA4、MYO5C、EPHA5、TRIM33CLIP1、ERC1PICALM、FRMD4A、RUFY2、TRIM24,其中最常見的是KIF5B。一項針對936名非小細胞肺癌患者的研究顯示,RET及其多種融合對象基因間的易位見于1%~2%的腺癌及腺鱗癌患者。同研究顯示,RET基因改變的腺癌分化顯著變差,更多患者(72.7%)小于等于60歲、常為從不吸煙的人群(81.8%),為實體亞型(63.6%),腫瘤常小于等于3cm伴有N2淋巴結轉(zhuǎn)移(54.4%)。RET重排可以通過FISH、NGSRT-PCR檢測,但不能被免疫組織化學(immunohistochemistry,IHC)法充分檢測。在非小細胞肺癌中,RET重排獨立于其他例如EGFR突變、ALKROSI重排之外,RET重排可能是非小細胞肺癌獨立的致癌驅(qū)動因素。

8.NRG1重排

神經(jīng)調(diào)節(jié)蛋白1基因(neuregulin 1 gene,NRG1)位于染色體10q23.1帶。NRG1融合是多種腫瘤的驅(qū)動基因,重排對象包括 CD74、ATPIBI、SDC4、RBPMS、SLC3A2、WRNVAMP2、ROCKIRALGAPAI、TNCMDK、DIP2BMRPL13、DPYSL2、PARP8ITGB1等。其中,CD74最常見。NRG1基因融合在非小細胞肺癌中概率<1%,在黏液腺癌中多見。通過NGS技術,在2079名肺腺癌患者中,有0.14%發(fā)生NRG1重排。通過高通量RNA測序,分析的8984個腫瘤的RNA序列數(shù)據(jù)表明,肺腺癌重排(SDC4-NRG1)發(fā)生率為0.22%。

9.FGFR1 異常

成纖維細胞生長因子受體1(fibroblast growth factor receptor 1,FGFR1)屬于一個跨膜受體酪氨酸激酶家族,包含FGFR1~4,FGFR1位于10q染色體上。通過對329例患者手術切除的淋巴結進行熒光原位雜交(FISH)分離分析,結果顯示FGFR1異常者為陰性UICC病理分期為I~II期的病例中,擴增的發(fā)生率約為12.5%,肺鱗狀細胞癌中擴增發(fā)生率為20.7%,較腺癌的2.2%、大細胞癌的13%明顯升高。同時,FGFR1擴增可能是早期非小細胞肺癌患者接受手術治療后的預后不良指標。另一研究應用二代測序(NGS)檢測了143I、IIII期鱗狀非小細胞肺癌初治病例,發(fā)現(xiàn)有16.9%FGFR基因突變。FGFR突變與淋巴結轉(zhuǎn)移的風險增加顯著相關。與沒有FGFR突變的患者相比,具有FGFR突變患者的總生存和無病生存期顯著減少,提示預后不良。

參考文獻

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