來自加州大學洛杉磯醫(yī)學院、新加坡**大學和中國醫(yī)學科學院北京協(xié)和醫(yī)學院等機構(gòu)的研究人員,采用全外顯子組測序和目標區(qū)域深度測序技術(shù)鑒別出了食管鱗狀細胞癌(ESCC)的一些新基因組及分子特征。這一重要的研究成果發(fā)表在3月30日的《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上。
中國醫(yī)學科學院北京協(xié)和醫(yī)學院的王明榮(Ming-Rong Wang)研究員和加州大學洛杉磯醫(yī)學院的林德晨(De-Chen Lin,音譯)博士是這篇論文的共同通訊作者。王榮明研究員長期從事腫瘤遺傳學和腫瘤分子生物學工作,研究方向為癌變分子機理及腫瘤分子標志,包括腫瘤細胞及分子遺傳學、腫瘤早期診斷及預警的分子標志、癌前病變與轉(zhuǎn)歸的分子機理、腫瘤侵襲性生長及轉(zhuǎn)移的分子機理、腫瘤蛋白質(zhì)表達譜等。
ESCC是世界上最常見的惡性疾病之一,且大部分的病例發(fā)生在中國,是中國第四位的癌癥相關(guān)死亡原因。不同于乳腺癌、結(jié)腸癌等這些得到廣泛研究的癌癥類型,近幾十年來食管鱗狀細胞癌的臨床診斷及治療方法有限,患者的5年生存率為15-25%。
以往的研究已經(jīng)揭示出了一些與3q26、9p21、11q13.3和8q24.3區(qū)域相關(guān)的ESCC頻發(fā)體細胞拷貝數(shù)變異(SCNV),以及PIK3CA7、TP53和NOTCH1等基因體細胞突變。然而這些研究對于ESCC基因組變異的了解往往僅限于小群的患者。因此,迫切需要更廣泛地鑒別ESCC的潛在基因組變異,闡明其分子基礎,引導開發(fā)出有的
靶向治療方法
在這篇新文章中,作者們報告稱對139對ESCC生殖細胞系和腫瘤進行了全外顯子組測試或目標區(qū)域深度測序,并對180多個ESCCs進行了體細胞拷貝數(shù)變異(SCNV)分析。除了已知的TP53、PIK3CA和NOTCH1,他們還鑒別出了一些新的突變基因,如FAT1、FAT2、ZNF750和KMT2D。進一步的SCNV評估、免疫組織化學,結(jié)果表明了這些新基因與ESCC的功能相關(guān)性。
值得注意的是,研究人員發(fā)現(xiàn)在這一癌癥類型中多種分子機制常常導致了RTK-MAPK-PI3K信號通路、細胞周期和表觀遺傳調(diào)控出現(xiàn)異常。他們還揭示出了大量的藥物可及的候選靶點,并鑒于XPO1存在基因突變以及蛋白質(zhì)過表達現(xiàn)象,研究人員將其視作治療靶點開展了更進一步的研究。
新研究揭示出了ESCC中一些新的遺傳損傷,這為了解食管腫瘤的發(fā)病機制以及開發(fā)出新的治療靶點提供了重要的分子基礎。