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    據(jù)英國(guó)《每日電訊報(bào)》7月31日?qǐng)?bào)道，美國(guó)斯坦福大學(xué)的科學(xué)家和素有“科學(xué)怪才”之稱的克雷格·文特爾領(lǐng)導(dǎo)的科研小組在《細(xì)胞》雜志上撰文指出，他們首次利用計(jì)算機(jī)制造出了“虛擬細(xì)菌”，其能模擬微生物的生命軌跡和一舉一動(dòng)?？茖W(xué)家們表示，最新突破或許有助于改進(jìn)入類對(duì)疾病的理解并為疾病找到新的療法。

    《每日電訊報(bào)》在報(bào)道中指出，生物學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)的聯(lián)姻讓科學(xué)家們能借用計(jì)算機(jī)腳本模擬生命，這將讓人類大大受益，并有助于回答人類最大也最基本的問(wèn)題“生命是什么？”。

    “代碼腳本”首次讓生物和計(jì)算機(jī)“聯(lián)姻”

    自古以來(lái)，當(dāng)兩種不同的科學(xué)思維碰撞在一起時(shí)，都會(huì)激起人們靈感的火花，讓人類做出更重大的科學(xué)突破，分子生物學(xué)的誕生就是如此。上世紀(jì)50年代中葉，研究遺傳學(xué)的生物學(xué)家開始同使用X射線研究物質(zhì)原子結(jié)構(gòu)的物理學(xué)家們合作，這場(chǎng)“聯(lián)姻”讓人類首次看到了DNA優(yōu)雅的雙螺旋結(jié)構(gòu)，分子生物學(xué)（在分子水平上研究生命現(xiàn)象的科學(xué)，主要通過(guò)研究核酸、蛋白質(zhì)等生物大分子的結(jié)構(gòu)、功能和生物合成等方面來(lái)闡明各種生命現(xiàn)象的本質(zhì)，研究?jī)?nèi)容包括光合作用、癌癥的發(fā)生等各種生命過(guò)程）這門新興學(xué)科也在1953年順勢(shì)興起，將對(duì)人類自身和疾病的研究推到更高的層次。

    無(wú)獨(dú)有偶，另外兩門科學(xué)也在慢慢靠近并相互結(jié)合。其中一個(gè)科學(xué)領(lǐng)域是生物學(xué)，主要專注于研究DNA指令，正是這些指令決定了活體生物是如何建立起來(lái)以及如何運(yùn)轉(zhuǎn)的；另一個(gè)領(lǐng)域計(jì)算機(jī)科學(xué)則專注于研究操作計(jì)算機(jī)運(yùn)行的代碼。

    備受爭(zhēng)議的基因組研究先鋒、美國(guó)生物學(xué)家克雷格·文特爾目前是讓這兩門科學(xué)“聯(lián)姻”的積極推手，其實(shí)，奧地利的量子力學(xué)天才埃爾溫·薛定諤早在1943年提出的“代碼腳本”這一概念正是生物學(xué)和計(jì)算機(jī)科學(xué)結(jié)合的雛形。

    薛定諤于1943年發(fā)表了一場(chǎng)具有里程碑意義的演講，在那場(chǎng)演講中，薛定諤提出了一個(gè)天才性的問(wèn)題：生命是什么？薛定諤問(wèn)道：一個(gè)受精卵如何能獲得“一些包含了該生物未來(lái)所有發(fā)育信息的代碼腳本。”為了回答這個(gè)問(wèn)題，薛定諤提出，染色體就像“非周期性（大分子）晶體”一樣，是一種由同分異構(gòu)元素連續(xù)組成的非周期晶體，構(gòu)成其的原子具有一個(gè)復(fù)雜的非重復(fù)性的模式；他也描述了該大分子內(nèi)“原子排列有序的結(jié)合”像摩斯代碼中的劃線和點(diǎn)一樣，擁有建立微生物的指令。

    這是科學(xué)家們首次對(duì)遺傳代碼進(jìn)行嚴(yán)肅的討論，盡管與很多同齡人一樣，薛定諤也曾錯(cuò)誤地認(rèn)為，遺傳代碼被寫入蛋白質(zhì)而非核酸中。然而，基于他1943年的演講而撰寫的《生命是什么》這本書卻給了很多人靈感。其中包括DNA研究領(lǐng)域的開創(chuàng)者、DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的發(fā)現(xiàn)者之一吉姆·沃森和文特爾。文特爾在演講中表示：“薛定諤的‘代碼腳本’為未來(lái)的很多發(fā)現(xiàn)指明了方向。”

    用計(jì)算機(jī)腳本模擬細(xì)菌

    現(xiàn)在，文特爾正在撰寫他自己的代碼腳本——使用計(jì)算機(jī)設(shè)計(jì)基因組。他說(shuō)：“我們正在嘗試?yán)糜?jì)算機(jī)，使用遺傳代碼合成出基因組，讓計(jì)算機(jī)科學(xué)和生物學(xué)完美地聯(lián)姻。”

    實(shí)際上，計(jì)算機(jī)不僅能模擬生命，也能模擬活著的細(xì)胞。幾天前，為了幫助人類理解一個(gè)細(xì)胞的復(fù)雜性，斯坦福大學(xué)的馬庫(kù)斯·卡沃特領(lǐng)導(dǎo)的科研團(tuán)隊(duì)與文特爾的研究機(jī)構(gòu)攜手合作，制造出了虛擬的生殖支原體細(xì)菌，并再現(xiàn)了該細(xì)菌的整個(gè)生命循環(huán)過(guò)程。該細(xì)菌是所有細(xì)菌中最簡(jiǎn)單的一種，它擁有已知的活體生物中最小的基因組，并且是第二種被排序的非共生微生物。1995年，文特爾對(duì)其基因組進(jìn)行了排序。

    生殖支原體細(xì)菌目前已經(jīng)成為首個(gè)被詳細(xì)建模的微生物，科學(xué)家們使用128臺(tái)計(jì)算機(jī)，模擬出了其525個(gè)基因中每一個(gè)基因的詳細(xì)情況，也在分子層面繪制出了該細(xì)菌從DNA到RNA再到名為代謝物的小分子的情況。

    科學(xué)家們表示，虛擬細(xì)胞和虛擬細(xì)菌將幫助他們厘清生命和疾病的本質(zhì)。當(dāng)人們談?wù)撃硞€(gè)“癌癥基因”時(shí)，其意思是，他們發(fā)現(xiàn)了一個(gè)基因，當(dāng)該基因出故障時(shí)，會(huì)引發(fā)癌癥。但是，當(dāng)人們?cè)敿?xì)研究一個(gè)癌細(xì)胞時(shí)就會(huì)發(fā)現(xiàn)，體內(nèi)2.3萬(wàn)個(gè)基因中的大部分基因都會(huì)受到影響，模擬基因組的整個(gè)工作情況，對(duì)于理解造成疾病的遺傳原因至關(guān)重要。

    文特爾表示，用計(jì)算機(jī)來(lái)模擬生命、設(shè)計(jì)生命并“再現(xiàn)生命”，標(biāo)志著科學(xué)研究將跨入一個(gè)新領(lǐng)域，借此，人類會(huì)比以往更接近“生命是什么”這一終極問(wèn)題的答案。