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PNAS:研究揭示肝細(xì)胞癌新發(fā)現(xiàn)

2015-02-09 17:05 閱讀:1380 來(lái)源:生物通 作者:學(xué)**涯 責(zé)任編輯:學(xué)海無(wú)涯
[導(dǎo)讀] 來(lái)自香港中文大學(xué)的研究人員通過(guò)大規(guī)模平行測(cè)序技術(shù)(massively parallel sequencing),發(fā)現(xiàn)肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma)患者血漿中存在異常伸長(zhǎng)和縮短的DNA分子。這項(xiàng)研究發(fā)布在了2月2日的《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》(PNAS)上。

    來(lái)自香港中文大學(xué)的研究人員通過(guò)大規(guī)模平行測(cè)序技術(shù)(massively parallel sequencing),發(fā)現(xiàn)肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma)患者血漿中存在異常伸長(zhǎng)和縮短的DNA分子。這項(xiàng)研究發(fā)布在了2月2日的《美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊》(PNAS)上。

    領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是香港中文大學(xué)的盧煜明(Y. M. Dennis Lo)教授。盧煜明教授是分子生物學(xué)的臨床應(yīng)用專(zhuān)家,尤其致力于人體內(nèi)血漿DNA和RNA的研究。盧教授早在1997年就發(fā)現(xiàn)了孕婦外周血中存在漂流的胎兒DNA,并發(fā)展出了一套新技術(shù)來(lái)準(zhǔn)確分析和度量母親血漿內(nèi)的胎兒DNA,被譽(yù)為無(wú)創(chuàng)產(chǎn)前診斷的奠基人。2013年入選美國(guó)科學(xué)院外籍院士(延伸閱讀:盧煜明教授PNAS發(fā)表測(cè)序新成果)。

    原發(fā)性肝癌是臨床上常見(jiàn)的消化系統(tǒng)惡性腫瘤之一,其中90%為肝細(xì)胞癌,在世界范圍內(nèi)發(fā)病率呈現(xiàn)上升趨勢(shì)。肝癌起病隱襲,早期診斷困難,大多數(shù)患者確診時(shí)已中晚期,且約90%的患者被診斷為肝癌時(shí)已是中晚期,而喪失手術(shù)機(jī)會(huì)。

    目前臨床上常用的肝癌診斷標(biāo)記物為甲胎蛋白,簡(jiǎn)稱(chēng)AFP.然而,AFP診斷肝癌的敏感度和特異度并不十分理想。在妊娠婦女、急慢性肝炎、生殖腺腫瘤和胃腸道腫瘤等人群中AFP亦可能升高。約40%的肝癌患者AFP并不升高,呈AFP陰性。因此,找到特異性和敏感性的肝癌診斷新方法迫在眉睫。

    1948年科學(xué)家們首次發(fā)現(xiàn)人體血液中存在著循環(huán)DNA,癌癥患者的循環(huán)DNA則發(fā)現(xiàn)于1977年。在那之后又過(guò)了17年,人們才發(fā)現(xiàn)這些DNA含有癌癥的標(biāo)志性突變,說(shuō)明它們來(lái)自于腫瘤。當(dāng)癌細(xì)胞破裂和死亡之時(shí),會(huì)釋放出循環(huán)腫瘤DNA(ctDNA)等內(nèi)容物,這些ctDNA基因組片段漂浮在血液之中。

    分析ctDNA為通過(guò)液體活檢標(biāo)本來(lái)實(shí)現(xiàn)實(shí)體瘤評(píng)估開(kāi)啟了新的可能性。盡管人們?nèi)找嬲J(rèn)識(shí)到它的臨床潛力,但對(duì)于這些ctDNA許多方面的生物特性卻仍不是很清楚。就這些血漿DNA分子的大小而言,許多研究報(bào)道稱(chēng)發(fā)現(xiàn)了延長(zhǎng)的腫瘤源性血漿DNA,而另一些研究的證據(jù)則表明腫瘤釋放出了縮短的血漿DNA分子。

    在這篇新文章中,作者們報(bào)告稱(chēng)對(duì)90名肝癌患者、67名慢性乙肝患者、36名乙肝相關(guān)肝硬化患者以及32名健康對(duì)照人群的血漿DNA大小情況進(jìn)行了詳細(xì)的分析。他們采用大規(guī)模平行測(cè)序以單堿基分辨率,在全基因組水平上測(cè)量了血漿DNA的大小。研究人員通過(guò)染色體臂水平z-score分析(CAZA)進(jìn)一步鑒別了這些腫瘤源性的血漿分子,以檢測(cè)它們的特異性大小情況。

    他們證實(shí)在肝癌患者的血漿中存在著數(shù)組異常長(zhǎng)和短的DNA分子。這些短DNA傾向于攜帶著一些腫瘤相關(guān)的拷貝數(shù)異常。研究人員進(jìn)一步證實(shí)在肝癌患者的血漿中線(xiàn)粒體DNA的量增高。這些分子比血漿中的核DNA要短得多。

    這些新研究結(jié)果增進(jìn)了人們對(duì)于腫瘤源性循環(huán)DNA大小情況的認(rèn)識(shí),并有可能進(jìn)一步提高人們利用血漿DNA來(lái)作為分子診斷工具的能力。
 


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