近日出版的《分子系統(tǒng)生物學(xué)》雜志發(fā)表了軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院放射與輻射醫(yī)學(xué)研究所、蛋白質(zhì)組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室楊曉明研究員和賀福初院士領(lǐng)導(dǎo)的科研團(tuán)隊(duì)聯(lián)合復(fù)旦大學(xué)、湖北大學(xué)等單位完成的研究論文。論文闡釋了目前世界上最大的人類(lèi)器官蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)連鎖圖框架,標(biāo)志著我國(guó)在人類(lèi)蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)研究領(lǐng)域進(jìn)入世界先進(jìn)水平。
生命有機(jī)體是由蛋白質(zhì)組成的“分子社會(huì)”,和人類(lèi)社會(huì)一樣,每個(gè)蛋白質(zhì)需要和許多不同的蛋白質(zhì)發(fā)生相互作用,構(gòu)成復(fù)雜關(guān)系網(wǎng)絡(luò)協(xié)調(diào)指揮幾乎所有的生命活動(dòng)。因此,全景式研究蛋白質(zhì)相互作用而得出的蛋白質(zhì)相互作用連鎖圖譜是解讀蛋白質(zhì)“天書(shū)”的重要“密匙”。據(jù)估算,人類(lèi)蛋白質(zhì)大約有13萬(wàn)對(duì)相互作用,當(dāng)前所有的已知數(shù)據(jù)僅鑒定了不到8%。
楊曉明和賀福初率領(lǐng)的科研團(tuán)隊(duì)依托蛋白質(zhì)組學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,建立了全國(guó)性的合作研究體系和國(guó)際先進(jìn)的高通量、自動(dòng)化蛋白質(zhì)相互作用研究平臺(tái)。篩選了5026種人類(lèi)肝臟蛋白質(zhì)相互作用,共獲得2582種肝臟蛋白質(zhì)之間的3484種高可信度相互作用,其中92%為人類(lèi)首次發(fā)現(xiàn)。該研究還揭示了肝臟特異表達(dá)蛋白質(zhì)、代謝酶、肝臟疾病蛋白質(zhì)及重要信號(hào)通路分子的相互作用特點(diǎn),提供了63個(gè)未注釋蛋白質(zhì)功能線索,135個(gè)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路間潛在的相互交聯(lián)分子,并預(yù)測(cè)了21個(gè)肝細(xì)胞癌相關(guān)蛋白質(zhì)。研究構(gòu)建了第一個(gè)人類(lèi)器官蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)框架,為類(lèi)似研究提供了可借鑒的研究思路;在國(guó)際上首次采用蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)闡釋人類(lèi)器官的功能調(diào)控特點(diǎn);為認(rèn)識(shí)肝臟疾病的發(fā)生分子機(jī)制和預(yù)防、診斷標(biāo)記物和治療靶點(diǎn)的發(fā)現(xiàn)奠定了基礎(chǔ)。
據(jù)悉,高通量、全局性研究特定生物系統(tǒng)所有蛋白質(zhì)的相互作用網(wǎng)絡(luò)是國(guó)內(nèi)外研究的熱點(diǎn)和難點(diǎn),該研究是中國(guó)科學(xué)家在國(guó)際上率先提出的“人類(lèi)肝臟蛋白質(zhì)組計(jì)劃”的重要研究?jī)?nèi)容之一。
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