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美國發(fā)現(xiàn)三陰性乳腺癌新突變

2013-01-21 11:45 閱讀:2419 來源:生物通 作者:網(wǎng)* 責(zé)任編輯:網(wǎng)絡(luò)
[導(dǎo)讀] 美國轉(zhuǎn)化基因組研究院(TGen)的研究人員通過全基因組測序,在轉(zhuǎn)移性三陰性乳腺癌(T**)中發(fā)現(xiàn)了之前未曾報道過的突變。這篇文章發(fā)表在近期的《Molecular Cancer Therapeutics》上。

  美國轉(zhuǎn)化基因組研究院(TGen)的研究人員通過全基因組測序,在轉(zhuǎn)移性三陰性乳腺癌(T**)中發(fā)現(xiàn)了之前未曾報道過的突變。這篇文章發(fā)表在近期的《Molecular Cancer Therapeutics》上。

  三陰性乳腺癌是指雌激素受體(ER)、孕激素受體(PR)和人表皮生長因子受體(HER2)均呈陰性的一種特殊類型乳腺癌。在西方人群中,三陰性乳腺癌占全部乳腺癌的10%-15%,尤以非洲裔人群多見。來自亞洲的報告顯示,三陰性乳腺癌發(fā)病率為7%-19%,與白種人相差不多。這種疾病本身具有較高的侵襲性,術(shù)后復(fù)發(fā)轉(zhuǎn)移風(fēng)險高,且缺乏內(nèi)分泌治療,抗HER2靶向治療的機(jī)會。

  領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是TGen的高級研究員、綜合癌癥基因組學(xué)部主任John Carpten。近年來,Carpten博士領(lǐng)導(dǎo)的研究小組利用新一代測序技術(shù),對多個腫瘤開展了深入的基因組學(xué)圖譜分析,包括前列腺癌、鼻咽癌、三陰性乳腺癌和結(jié)腸癌等。在這項研究中,Life Technologies公司也給予了支持。

  研究小組利用Life Tech的SOLiD 4平臺對來自不同族裔的轉(zhuǎn)移性T**患者的14個腫瘤樣本進(jìn)行了分析,在十幾個基因中發(fā)現(xiàn)了明顯的突變及其他改變。這些腫瘤中突變最頻繁的基因是TP53腫瘤抑制基因,14個腫瘤中的7個有突變。而在兩名非洲裔美國人身上,也檢測到另一個腫瘤抑制基因CTNNA1的異常。ERBB4基因也有改變,此基因參與了懷孕和哺乳期間的乳腺腺體成熟,但之前從未與轉(zhuǎn)移性T**相關(guān)聯(lián)。

  研究還包含了“異常值分析”,評估了每個腫瘤的表達(dá)模式,并與研究中的其他腫瘤進(jìn)行比較。在研究的隊列入群中過表達(dá)的癌基因有:ALK, AR, ARAF, BRAF, FGFR2, GLI1, GLI2, HRAS, HSP90AA1, KRAS, MET, NOTCH2, NOTCH3和SHH。表達(dá)明顯降低的癌基因有:BRCA1, BRCA2, CDKN2A, CTNNA1, DKK1, FBXW7, NF1, PTEN和SFN。

  每個腫瘤在基因組上都是獨特的,但在14個腫瘤中,有9個都包含了特定細(xì)胞通路的改變:RAS/RAF/MEK/ERK和PI3K/AKT/MTOR,有的是一條改變,有的是兩條都改變。

  作者認(rèn)為,轉(zhuǎn)移性T**的全基因組和轉(zhuǎn)錄組分析讓人們深入了解了這種癌癥的體細(xì)胞事件。這些基因組數(shù)具有望指導(dǎo)患者參與研究性的治療試驗,并為未來試驗提供假設(shè)。

  Life Technologies公司的首席醫(yī)療官Paul Billings博士表示:“研究強(qiáng)調(diào)了基因組測序在改善癌癥治療上的潛在臨床價值。我們希望在不遠(yuǎn)的將來,更多患者和醫(yī)生能夠用到測序?;蚪M測序最終將成為腫瘤科醫(yī)生的標(biāo)準(zhǔn)工具,讓他們能夠為每位患者度身定制療法。”


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