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新一代DNA測序技術(shù)助力癌癥抗原篩查

2013-06-27 11:00 閱讀:1732 來源:生物360 作者:網(wǎng)* 責任編輯:網(wǎng)絡(luò)
[導(dǎo)讀] 日前,美國國家癌癥研究所等機構(gòu)的科學(xué)家們開發(fā)出了一種新的流線化方法,可快速鑒別出黑色素瘤中可被腫瘤浸潤淋巴細胞識別的獨特突變抗原。過去的研究證實腫瘤浸潤淋巴細胞能夠減少癌癥病變,這些獨特的蛋白小片段是腫瘤浸潤淋巴細胞的識別靶標。

    日前,美國國家癌癥研究所等機構(gòu)的科學(xué)家們開發(fā)出了一種新的流線化方法,可快速鑒別出黑色素瘤中可被腫瘤浸潤淋巴細胞識別的獨特突變抗原。過去的研究證實腫瘤浸潤淋巴細胞能夠減少癌癥病變,這些獨特的蛋白小片段是腫瘤浸潤淋巴細胞的識別靶標。
 


    此前的一項 2 期臨床試驗顯示,70% 的黑色素瘤患者接受自體腫瘤浸潤淋巴細胞治療,可導(dǎo)致轉(zhuǎn)移病灶顯著消退。

    在這項最新研究中,科學(xué)家對患者過繼轉(zhuǎn)移了自身的免疫細胞,近 40% 的患者在至少 5 年的時間內(nèi)腫瘤完全消退。為了更好地了解它的作用機制,研究人員開發(fā)了一種新方法,有助于更快地篩查出這些腫瘤浸潤淋巴細胞識別的突變抗原。

    腫瘤浸潤淋巴細胞是指那些離開血流進入到腫瘤中的白細胞。當存在大量的腫瘤浸潤淋巴細胞時,表明機體啟動了對抗腫瘤的免疫反應(yīng)。在許多的癌癥中,研究人員均開展了相關(guān)的研究,定量這些腫瘤浸潤細胞,并將其數(shù)量與腫瘤特征和結(jié)果關(guān)聯(lián)起來。

    研究人員認為,更好地了解腫瘤浸潤淋巴細胞誘導(dǎo)癌細胞消退的機制,將提高患者自體移植細胞治療的效力,并且有可能揭示出腫瘤生長新機制。

    研究人員指出,新技術(shù)能夠更快、更容易地鑒別出免疫系統(tǒng)T細胞識別的突變基因抗原。從前,研究人員都是通過生成以及費力地篩查來自腫瘤的DNA庫,來完成這樣的工作。這一新篩查技術(shù)有可能還適用于在許多癌癥類型中鑒別突變抗原。

    新方法采用了新一代 DNA 測序技術(shù),挖掘全外顯子序列數(shù)據(jù),鑒別在患者中表達的突變蛋白。隨后研究人員合成出候選的突變T細胞抗原表位,并用一種主要組織相容性復(fù)合物結(jié)合算法對候 選表位進行了評估。利用這種方法,研究人員鑒別出了在患者腫瘤細胞上表達,能被腫瘤浸潤淋巴細胞識別的突變抗原。


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