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我學(xué)者揭示人類疾病基因特征

2011-12-29 10:06 閱讀:721 來源:科學(xué)時報(bào) 責(zé)任編輯:申瓊鶴
[導(dǎo)讀] 近日,國際著名學(xué)術(shù)期刊《人類分子遺傳學(xué)》在線發(fā)表了中科院上海生命科學(xué)研究院計(jì)算生物學(xué)所徐書華和金力研究組的研究成果。該研究系統(tǒng)分析了人類疾病相關(guān)基因的特征,并與其他各類基因進(jìn)行了全面比較。這對認(rèn)識人類疾病基因的特性,了解致病遺傳變異的產(chǎn)生

    近日,國際著名學(xué)術(shù)期刊《人類分子遺傳學(xué)》在線發(fā)表了中科院上海生命科學(xué)研究院計(jì)算生物學(xué)所徐書華和金力研究組的研究成果。該研究系統(tǒng)分析了人類疾病相關(guān)基因的特征,并與其他各類基因進(jìn)行了全面比較。這對認(rèn)識人類疾病基因的特性,了解致病遺傳變異的產(chǎn)生、基因組分布、自然選擇和進(jìn)化機(jī)制,以及理解疾病基因表達(dá)和調(diào)控網(wǎng)絡(luò)模式有重要理論意義,對研究復(fù)雜疾病的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)也具參考價值。

    傳統(tǒng)上,遺傳類疾病可分為罕見的孟德爾遺傳病和較常見的復(fù)雜疾病。孟德爾遺傳病往往由單基因控制,在人群中的發(fā)病率很低,表現(xiàn)出很強(qiáng)的家族聚集性,如鐮刀性貧血、白化病、色盲等,其單基因變異效應(yīng)較強(qiáng)。復(fù)雜疾病往往受多個基因控制,在人群中發(fā)病率高,如癌癥、高血壓、糖尿病等,其遺傳模式復(fù)雜,每個基因變異的效應(yīng)很弱。

    然而,此次研究人員通過對最新的遺傳類疾病基因數(shù)據(jù)庫分析發(fā)現(xiàn),孟德爾遺傳病基因和復(fù)雜疾病基因并不像通常的分類那樣界限分明。相反,兩類疾病基因存在大量的重疊,即與兩類疾病共同關(guān)聯(lián)的基因(雙聯(lián)基因),而且比基于統(tǒng)計(jì)學(xué)隨機(jī)假設(shè)的預(yù)期數(shù)目多出8倍。研究人員對已知的人類基因進(jìn)行了分類,包括雙聯(lián)基因、必需基因、單基因疾病基因、復(fù)雜疾病基因和其他基因。

    研究者發(fā)現(xiàn),雙聯(lián)基因和復(fù)雜疾病基因都受到了近期的正向自然選擇,而必需基因和單基因疾病基因受到較強(qiáng)的負(fù)向選擇。對物種間差異數(shù)據(jù)分析表明,必需基因總是最保守,這支持必需基因在漫長的進(jìn)化史中總是受到最強(qiáng)的負(fù)向選擇;而雙聯(lián)基因在保守性上排在第二位,提示其在進(jìn)化中也受到較強(qiáng)的負(fù)向選擇。

    同時,該研究比較了各類基因在基因表達(dá)模式、基因結(jié)構(gòu)等方面的差異。研究人員推測,雙聯(lián)基因的很多特征和它們在復(fù)雜疾病和單基因疾病中的雙重作用相關(guān)。

    這是首個對雙聯(lián)基因特征進(jìn)行系統(tǒng)分析的研究,結(jié)果同時也對其他四類基因的特征有新的認(rèn)識。比如該研究發(fā)現(xiàn),很多復(fù)雜疾病基因落在拷貝數(shù)變異區(qū)域,表明拷貝數(shù)變異可能在多種復(fù)雜疾病的遺傳因素中起重要作用。


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